“分子检测对抗击COVID-19大流行至关重要”

分子检测
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位于Osnabrück的Niels-Stensen-Kliniken小组中心实验室立即建立了自己的SARS-CoV-2分子检测测试设施。我们与实验室医学研究所所长、医学博士迈克尔·埃伦(Michael Erren)就他的策略以及诊断性分子检测在抗击大流行中的重要性进行了交谈。


Erren博士,nies - stensen - kliniken集团由Osnabrück及其附近的15个医疗设施组成,包括9个诊所——你是城市及其周边地区的主要医疗保健提供者。你第一次意识到你面临的挑战是什么时候?


我在1月中旬与我的同事们讨论了新型冠状病毒,因为一种新的病原体总是对全球卫生系统的潜在威胁。但当我们开始收到来自中国的关于COVID-19快速传播和亚急性死亡人数惊人的报告时,这真的让我感到震惊。然后,在2020年1月23日,拥有100多万居民的工业城市武汉被完全封锁,并保持了数周。那是一个警钟。对我来说,毫无疑问,一场全球性的流行病即将来临,它很可能会使1997年的禽流感、2002年的SARS-CoV-1和2009年的猪流感等以往的流行病黯然失色。



Michael Erren医学博士,德国Osnabrück的Niels-Stensen-Kliniken小组实验室医学、输血医学、微生物学和卫生学研究所所长。


你最初的反应是什么?


当时,我们的中心实验室没有冠状病毒检测设施,我们不得不将样本送到国家检测机构。我和我们的管理层谈过,并立即得到了建立我们自己的工厂的许可。对我们来说,在重要的病毒诊断问题上做到自给自足是绝对关键的,这样我们才能迅速和独立地采取行动——无论是在照顾我们的病人,还是在确保我们的工作人员的安全方面。随着流行病的迅速升级,我们很快意识到在测试能力和处理时间上独立于外部病毒诊断提供商的优势。我们的目标是优先照顾危重病人,及时治疗他们。由于分子诊断测试具有卓越的分析灵敏度和特异性,因此对抗击COVID-19大流行至关重要。


在你的集水区情况如何发展?


迄今为止,德国相对较好地度过了危机——同样的情况也适用于我们的流域地区。目前,我们每天测试多达600人。这些人包括疑似病例、已患病并准备手术的患者、经常与COVID-19患者密切合作的工作人员,以及在我们的养老院和养老院生活或工作的个人。我们在早班和晚班中进行了近400次时间关键测试,可以在同一天或最迟在24小时内处理结果。对于时间紧迫程度较低的案件,我们与由弗兰茨-约瑟夫·施密茨教授领导的MVZ Laborzentrum Weser合作。


当涉及到选择您自己的分子诊断基础设施,您选择VERSANT®kPCR分子系统1从西门子Healthineers。你做出这个选择的理由是什么?


一些因素是有用的:对于一个,对大流行爆发的测试系统有大量的需求,导致尚未预期的巨额供应瓶颈。这就是为什么我们想要与我们可以信任的供应链的提供商以及我们所知道的提供商在处理技术问题方面提供快速可靠的支持。然后我们还在寻找一个具有快速和简化的工作流程的系统,并且容易集成。我们希望自动化系统,几乎要求任何手动干预,即使具有高样本吞吐量,也可以减轻我们的实验室工作人员的压力。最后,该解决方案还必须可靠地保护我们的员工免受可能的感染。

你认为还有其他的优势吗?


嗯,还有以下益处在相同的热PCR条件下进行分子FTD PCR试验。当我们在达到诊断时必须区分不同的呼吸道感染时,这将在冬季尤为重要。SARS-COV-22,流感病毒(流感A,B,H1N1)和RSV3都可以在同一PCR循环分子上同时加工。除了高特异性之外,我们还对公布的数据印象深刻的关于FTD-SARS-COV-2 Test2的高灵敏度。我们也可以在实验室中确认这种高敏感性。由于低病毒浓度或收集的鼻子或喉咙拭子,将忽略感染SARS-COV-2的人们感染的风险。具有高灵敏度,我们还在越来越多地进行的池测试中实现有效的结果,例如在筛选员工或整个学校或在返回游客的测试中。就临床护理而言,进一步的好处是,个体感染的过程可以基于PCR原料数据(CT值) - 至少半定量表征。一方面,它可用于识别具有非常高的病毒载荷(CT值<20)的受感染者,他们有可能成为“超级概率”。另一方面,在症状发生并具有CT值> 30后十天仍然表现出RNA的样品,我们可以得出结论,病毒浓度低于临界感染剂量,或者只有RNA残留物留下 - 即, material that is no longer viable or culturable. High Ct values can therefore be used as a criterion in deciding whether to release patients from the clinic.



自动VERSANT kPCR提取模块正在装载预先准备好的患者样本。


当前的形势对你的员工有什么影响?


工作量当然比COVID-19危机前高得多,同时感染风险也在增加。因此,我们非常重视保护措施,以便在检测次数非常高的情况下,将对我们员工的风险降到最低。到目前为止,这个策略非常成功。VERSANT kPCR平台上高度的测试自动化提供了很大的帮助。员工只需要在测试开始时处理一次样品,在无菌的生物安全柜中将样品与少量的裂解缓冲液混合,然后转移到试管中。所有进一步的步骤都由提取模块自动处理。


您是否认为Covid-19流行病可以通过SARS-COV-2测试来控制?


有一件事是肯定的,没有测试是不会发生的。然而,我主张有区别的检测策略,而不是没有任何合理分层的大规模筛查。一项测试总是仅仅提供它所拍摄时间的一个情境快照。今天的测试结果呈阴性的人可能明天就会被感染,阴性的测试结果很容易导致错误的安全感。如有疑问,试验应在5天后重复进行——这是典型的孵育时间加上安全裕度。此外,咽拭子必须正确使用,这并不总是容易的。此外,病毒只能在第一周在喉咙中可靠地检测到,通常在第二周就不存在了。我认为在热点地区和高危人群中进行测试更有意义。反对大规模筛查的另一个论点是,一项检测的诊断有效性,即所谓的阳性和阴性预测值,并不仅仅取决于敏感性和特异性,还取决于流行率——在特定人群中的感染率。感染发生的频率越低,检测的随机性越强,统计上出现“假阳性”结果的可能性就越大。 Therefore, a test should only be carried out if the clinical symptoms and the individual circumstances suggest an increased probability that the group to be tested includes individuals infected with SARS-CoV-2. Indiscriminate mass screening of the general population is not very effective and would overstretch our limited testing facilities.


医学博士Michael Erren使用PCR装置的扩增和检测模块对SARS-CoV-2的分析结果进行评估。


你是否担心德国会在秋季或冬季受到新一轮浪潮的冲击?
我们必须假设感染率将增加寒冷的季节。因为从秋天到来,游戏中有各种现象。含有病毒的气溶胶在较冷的空气中存活的气溶胶比温暖的温度更长。较冷的空气降低了病毒的脱水和失活,这反过来又增加了其环境稳定性。室内空间不如室外空间通风较差,导致较低的稀释效果。然后还有更多的人在室内:他们倾向于坐着彼此靠近。此外,由于其他呼吸道病原体引起的刺激,粘膜更容易受到损坏。当粘膜具有较低的温度和血液供应较低时,免疫系统的防御机制减少。最后,温度对呼吸道病毒复制的能力具有明显的影响。
我们希望它不会变成那样流行病学和实验室诊断早期预警系统能够得到优化这样我们就能及早发现这些发展以便能够采取应对措施。


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发布时间:2020年10月28日,星期三



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